In der Bibliothek des Vatikans wird Professore Leonardo Abbiati ermordet aufgefunden. Ein unbekannter Täter hat ihn vom Balkon der Bibliothek in die Tiefe gestoßen. Da gleichzeitig zwei sehr wertvolle Bücher aus der Zeit Christi verschwunden ist, geht man im Vatikan von einem gestörten Einbrecher als Täter aus. Nur seine Eminenz zweifeln an dieser Geschichte, da Abbiati nur einen Tag zuvor etwas sehr dringendes mit ihm besprechen wollte, wozu es aber nicht mehr gekommen ist. Er bittet seinen Freund Don Matteo in den Vatikan zu kommen, da er von dessen vielen erfolgreichen Ermittlungen gehört hat. Don Matteo aber besteht darauf, dass er die Fälle immer nur mit Hilfe der Polizei gelöst hat und so fordert der Vatikan offziell die Amtshilfe von Capitano Anceschi und Maresciallo Cecchini an. Um im Vatikan aber nicht für Unruhe zu sorgen, sollen die beiden als Missionarsschüler verdeckt ermitteln, was sie dann auch tun. Die erste Spur führt zu einer Studentin Abbiatis, die ein Verhältnis mit Abbiati hatte und die, wie sich herausstellt, für das Verschwinden eines der beiden Bücher verantwortlich ist. Als dann aber bei ihren Bruder das zweite verschwundene Buch gefunden wird, wird dieser plötzlich zum Hauptverdächtigen. Und schließlich wäre da auch noch der Verlobte der Studentin, der Abbiati natürlich aus Eifersucht auch getötet haben könnte. Erst mit einer List gelingt es Don Matteo, Anceschi und Cecchini den wahren Mörder zu entlarven.
Eine echte Besonderheit dieser Episode ist die Tatsache, dass der Haupthandlungsstrang nicht in Gubbio, sondern im Vatikan spielt. Es gibt aber auch eine Nebenhandlung in Gubbio, die sich hauptsächlich um den ersten Auftritt des kleinen Mädchens Camilla dreht.
Es handelt sich bei dieser Episode um die zweite Folge der vierten Staffel der Serie Don Matteo, durchgehend gezählt ist es Folge 50.
Die Serie Don Matteo wurde trotz des großen Erfolgs in Italien bisher nicht in Deutschland veröffentlicht, so dass es auch keine deutschen Folgentitel gibt. Ins Deutsche übersetzt heißt diese Episode "Verbrechen in der Bibliothek".